蛋白質體核心實驗室

設施委員:

研究助技師:

研究助理:

  • 陳瑾玟
  • 嚴孝榕

連絡電話:

  • 02-27871157 (許全智)
  • 02-27871030 (實驗室)

電子信箱:

實驗室位置:

  • 農業科技大樓2樓A227室

歡迎來到植物暨微生物學研究所蛋白質體核心實驗室網頁。蛋白質體核心實驗室目前有三位具蛋白質體分析經驗的成員，並且有一台四極柱軌道阱混成質譜儀。我們提供中研院植微所及農生中心的研究者最先進的液相層析串聯式質譜蛋白體學服務。我們提供的服務及分析樣品種類非常多樣性。服務分為兩大類：發現蛋白質體學與標的蛋白質體學。發現蛋白質體學的服務包括蛋白質身份鑑定、蛋白質後轉譯修飾鑑定、蛋白質交互作用鑑定、大規模蛋白質體學定量；分析的樣品種類橫跨了植物、細菌及真菌。我們擁有常用蛋白質體學鑑定及分析軟體的資源，提供我們的使用者進行質譜數據分析。

蛋白質體核心實驗室的目標主要有三個。第一、利用尖端的質譜技術對植物生物學及微生物學進行更深入的了解。質譜蛋白質體學能提供研究者宏觀角度探討生物問題並且加速其研究進程。第二、開發新穎的蛋白質體學方法並應用在特異的研究題目。第三、舉行使用者教育訓練，提供使用者最新的質譜蛋白體學知識及數據處理分析技巧。

服務項目

發現蛋白質體學

標的蛋白質體學

服務費用

樣品分析流程

  • 專案建立
    1. 使用者與蛋白質體核心實驗室成員討論專案目的
    2. 蛋白質體核心實驗室決定分析樣品流程
  • 專案執行
    1. 使用者繳交送件表單及樣品給核心實驗室
    2. 核心實驗室進行樣品前處理及質譜分析
  • 專案報告與帳單
    1. 核心實驗室寄送樣品分析報告給使用者
    2. 核心實驗室寄送分析費用帳單給使用者
    3. 使用者繳交費用

樣品送件表單

儀器

有用連結/工具

代表性文獻

  • 使用者
  1. Wong MM, Bhaskara GB, Wen TN, Lin WD, Nguyen TT, Chong GL, Verslues PE. (2020) Phosphoproteomics of Arabidopsis Highly ABA-Induced1 identifies AT-Hook-Like10 phosphorylation required for stress growth regulation. Proc Natl Acad Sci U.S.A. 116(6):2354-2363.
  2. Kanno T, Venhuizen P, Wen TN, Lin WD, Chiou P, Kalyna M, Matzke AJM, Matzke M. (2018) PRP4KA, a Putative Spliceosomal Protein Kinase, Is Important for Alternative Splicing and Development in Arabidopsis thaliana. Genetics. 210(4):1267-1285.
  3. Bhaskara GB, Wen TN, Nguyen TT, Verslues PE. (2017) Protein Phosphatase 2Cs and Microtubule-Associated Stress Protein 1 Control Microtubule Stability, Plant Growth, and Drought Response. Plant Cell 29(1):169-191.
  4. Rodríguez-Celma J, Tsai YH, Wen TN, Wu YC, Curie C, Schmidt W. (2016) Systems-wide analysis of manganese deficiency-induced changes in gene activity of Arabidopsis roots. Sci. Rep. 6:35846.
  5. Cho HY, Wen TN, Wang YT, Shih MC. (2016) Quantitative phosphoproteomics of protein kinase SnRK1 regulated protein phosphorylation in Arabidopsis under submergence. J. Exp. Bot. 67(9):2745-60.
  • 許全智
  1. Wang, P.*; Hsu, C.-C.*; Du, Y.; Zhu, P.; Zhao, C.; Fu, X.; Zhang, C.; Paez, J. S.; Macho, A. P.; Tao, W. A.; Zhu, J.-K. (2020) Mapping proteome-wide targets of protein kinases in plant stress responses. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 117 (6), 3270-3280.
  2. Hsu, C.-C.; Tsai, C.-F.; Tao; W. A.; Wang, P. (2020) Phosphoproteomic Strategy for Profiling Osmotic Stress Signaling in Arabidopsis J. Vis. Exp. 160, e61489.
  3. Kim, T.-W.*; Park, C. H.*; Hsu, C.-C.*; Zhu, J.-Y.; Hsiao, Y.; Branon, T.; Xu, S.-L.; Ting, A. Y.; Wang, Z.-Y. (2019) Application of Turbo-ID-mediated proximity labeling for mapping a GSK3 kinase signaling network in Arabidopsis. bioRxiv, doi.org/10.1101/629675.
  4. Hsu, C.-C.; Zhu, Y.; Arrington, J. V.; Paez, J. S.; Wang, P.; Zhu, P.; Chen, I.-H.; Zhu, J.-K.; Tao, W. A. (2018) Universal plant phosphoproteomics workflow and its application to tomato signaling in response to cold stress. Mol. Cell. Proteomics 17(10), 2068-2080.
  5. Wang, P.*; Zhao, Y.*; Li, Z.*; Hsu, C.-C.*; Liu, X.; Fu, L.; Hou, Y.-J.; Du, Y.; Xie, S.; Zhang, C.; Gao, M.; Cao, M.; Huang, X.; Zhu, Y.; Tang, K.; Wang, X.; Tao, W. A.; Xiong, Y.; Zhu, J.-K. (2018) Reciprocal regulation of the TOR kinase and ABA receptor balances plant growth and stress response. Mol. Cell 69(1), 100-112.