隨著高通量定序 (High-Throughput Sequencing, HTS) 技術的蓬勃發展，次世代定序 (NGS) 與第三代定序 (TGS) 實務上已取代傳統生物晶片 (Microarray)，成為現今基因體學與表現體學研究的黃金標準。目前，已廣泛應用於基因表現偵測、small RNA 分析、ChIP 定序、SNP 檢測及新物種全基因組定序等領域。

我們深知「高品質的定序文庫 (Library) 是獲得可靠定序數據的絕對關鍵」。因此，本部門針對不同應用領域，提供涵蓋 NGS 與 TGS 平台的標準化與客製化文庫製備服務，並持續投入新穎文庫建構方法的研發。

為加速研究進程，G-TeC 已與院內定序核心設施及業界優質的定序公司建立穩定的合作管道。由本部門產出的高品質定序文庫，可直接轉交定序單位上機。這不僅有效縮短了定序數據等待時間，更讓研究人員能享有經濟、便利，且隨時與最新定序技術同步的高效能服務。

服務項目

1. 高通量定序 (HTS) 文庫製備服務

► Illumina Sequencing Platform (Library Preparation Services)

• Genomic DNA-seq
• ChIP-seq
• DAP-seq (DNA Affinity Purification sequencing)
• Enzymatic Methyl-seq (EM-seq)
• Microbiome DNA enrichment
• RNA-seq (poly-A enrichment or rRNA depletion)
• miRNA-seq
• Parallel Analysis of RNA Ends (PARE)
• Ribosome Footprinting / Ribo-seq
• PAT-seq (PolyA-Tag)
• 16S/ITS amplicon
• Ultra-low input RNA-seq (> 10 pg RNA)
• Custom NGS library design and construction
• Library QC and multiplex pooling

► Oxford Nanopore Technologies (ONT) Platform (Library Construction & Sequencing)

• Genomic DNA and native barcoding sequencing
• Rapid barcoding small genome sequencing
• Direct RNA sequencing
• Direct cDNA barcoding sequencing
• cDNA-PCR barcoding sequencing

► 10x Genomics Chromium X Platform (Single-Cell / Single-Nucleus Library Preparation)

• Single-cell / Single-nucleus RNA-seq
• Single-nucleus ATAC-seq

2. 微滴式數位 PCR 與核酸品質分析

► 微滴式數位 PCR (ddPCR)：採用 QX600 系統進行核酸絕對定量，適合應用於低量基因表現偵測、拷貝數變異 (CNV) 分析，以及罕見突變檢測。

► 核酸品質分析：提供 Agilent Bioanalyzer、Agilent Fragment Analyzer 及 Qubit 檢測服務，以精確評估核酸的濃度與完整性。

主要儀器

• Agilent Bioanalyzer
• Agilent Fragment Analyzer
• NanoPhotometer NP80
• Qubit 4.0
• Covaris M220 Focused ultrasonicator
• Sage Science BluePippin DNA size selection
• 10x Genomics Chromium X
• BioRad droplet digital PCR QX600 system
• PCR machines

樣本送件與服務諮詢

為確保樣本處理品質與最佳的分析結果，樣本送件前請務必提前與我們聯繫，以利安排實驗排程。相關服務送件表單，請依您的所屬單位透過以下方式取得：

• 植微所 (IPMB) 使用者：請登入植微所內部系統下載送樣表單。
• 非植微所 (Non-IPMB) 使用者：關於服務細節、表單索取與專案合作，請逕洽核心負責人周素珍研究技師（Email：sjchou@gate.sinica.edu.tw；電話：02-27871072）。

儀器設備