[施臥虎] 一種不完美的教條
發稿時間:相較於轉錄層級調查的直接性,植物細胞的全基因組轉譯圖譜描繪在技術上仍具挑戰性,因此至今研究相對有限。蛋白質編碼基因的表現效率具有高度可變性,導致調控基因活性的各層級之間存在明顯的不一致。Ribo-Seq(核糖體輪廓分析)是一種極具價值的工具,可用以估算轉譯效率,惟目前可用於植物的數據集仍屬稀少。於本數據說明中,Isabel Cristina Vélez-Bermúdez(通訊作者)、Wen-Dar Lin、Shu-Jen Chou、Ai-Ping Chen 及 Wolfgang Schmidt 比較了來自阿拉伯芥(Arabidopsis)幼苗根與莖部,以mRNA定序(RNA-Seq)與核糖體足跡分析(Ribo-Seq)所產生的RNA表現與轉譯族群清單。該數據集提供了關於蛋白質編碼mRNA轉譯適能的資訊,有助於全面描繪基因體中各層級基因調控活動的全貌。