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[施臥虎] 核醣體分析:捕捉轉譯的過程

核醣體分析 (Ribo-seq) 是一種高解析度的工具,用以評估植物受環境或生長信號刺激後的特定信使 RNA (mRNA) 的”轉譯適應性(translational fitness)”。 該技術基於分離出受核醣體保護的 mRNA 片段,然後對其片段足跡進行大規模平行序列測序,以及測量核糖體在mRNA轉錄本上的密度。施臥虎研究團隊與植微所《基因體學技術核心實驗室》周素珍和陳艾屏,以及《生物資訊核心實驗室》林文鐽,共同開發了適用於模式植物阿拉伯芥(Arabidopsis thaliana)的Ribo-seq詳細逐步操作的實驗方法 (STAR protocols)。通訊作者中的Isabel Vélez-Bermúdez 為技術聯絡人,Wolfgang Schmidt 為主要聯絡人。

Link: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2023.102520