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[許全智] 結合鄰近標記法與磷酸化蛋白質體學描繪BIN2訊息傳遞網絡

Kim, Park, and Hsu et al., 2023 The Plant Cell

結合氮穩定同位素標記與鄰近標記法鑑定阿拉伯芥中BIN2鄰近蛋白質的流程圖

闡明激酶與受體之間的關係對於研究蛋白質後轉譯修飾網絡系統是至關重要。由於激酶與受體之間交互作用時間短暫,使得目前系統性的研究訊息傳遞仍有技術性上的困難。我們在此篇利用TurboID鄰近標記法結合質譜技術用以捕獲激酶的受體。我們鑑定了超過四百個新穎BIN2激酶的鄰近蛋白質。我們發現這些BIN2鄰近蛋白質有很大比例其蛋白磷酸化也是與BIN2的活性相關,說明了這些蛋白很有可能是BIN2的直接受體。我們結合鄰近標記法與磷酸化蛋白質體學建立了BIN2激酶在阿拉伯芥中的訊息傳遞網絡並且發現了BIN2激酶參與調控轉錄、RNA修飾、轉譯起始、囊泡轉運以及細胞骨架組織的新功能。我們這項工作呈現了一個鑑定植物蛋白後轉譯修飾網絡的有效方法,並且能應用於研究控制植物生長與環境適應的重要細胞功能。

Kim, Park, and Hsu et al (2023) Mapping the signaling network of BIN2 kinase using TurboID-mediated biotin labeling and phosphoproteomics

Link:https://academic.oup.com/plcell/advance-article/doi/10.1093/plcell/koad013/6993989