蛋白質體核心實驗室

現任委員

 

研究副技師:

 

研究助理:

  • 陳瑾玟
  • 嚴孝榕
蛋白質體核心實驗室(http://ipmb.sinica.edu.tw/proteomics/) 提供植物暨微生物學研究所及農業生物科技研究中心實驗室以奈米流速液相層析-電洒離子化-串聯式質譜為基礎的蛋白質身份鑑定、蛋白質後轉譯修飾分析服務、 及以等重試劑標記胜肽的方法進行蛋白質體定量分析的服務。另具備蛋白質二維電泳分離實驗及分析所需之設備及軟體提供同仁使用,並提供同仁研究蛋白質體學技 術的咨詢及教育訓練。核心實驗室亦積極採用及開發新的蛋白質體學研究技術以提升及維持最新的技術方法以服務同仁,如蛋白質的差異表現定量分析,利用多維液 相管柱層析的技術來分離蛋白質/胜肽以增進蛋白質質譜定性及定量的分析,磷酸化蛋白質的鑑定及磷酸化位置的分析,及標的蛋白質的檢測及定量分析。
 

儀器設備:

  • 奈米級流速液相層析-電洒離子化-串聯式質譜儀系統(Q Exactive MS, Dionex nanoUHPLC, Thermo Scientific)
  • 二維蛋白質電泳設備 (IPGphor 3 for IEF, Protean II XL Multi-Cell and Ettan DALTsix Electrophoresis Unit for SDS-PAGE)
  • 二維蛋白質電泳膠片雷射螢光掃瞄系統 (Typhoon 9400 Scanner, ImageScanner III)
  • 二維蛋白質電泳膠片影像分析軟體 (ImageMaster 2-D Platinum v.7.0, PDQuest v.7.3)
  • 二維蛋白質電泳膠片螢光影像分析軟體 (DeCyder 2-D differential Analysis v. 5.0)
  • 質譜蛋白質身份鑑定分析軟體 (Mascot Server v.2.4, Proteome Discoverer v.1.4)

 

 

 

Selected Publications

Lan P, Li W, Wen TN, and Schmidt W. (2012) Quantitative phosphoproteome profiling of iron-deficient Arabidopsis roots. Plant Physiol. 159:403-417.

Hsu CA, Wen TN, Su YC, Jiang ZB, Chen CW, and Shyur LF. (2012) Biological degradation of anthroquinone and Azo dyes by a novel laccase from Lentinus sp. Environ Sci Technol 46:5109-5117.

Lo YS, Cheng N, Hsiao LJ, Annamalai A, Jauh GY, Wen TN, Dai H, and Chiang KS. (2011) Actin in mung bean mitochondria and implications for its function. Plant Cell 23:3727-3744.

Lan P, Li W, Wen TN, Shiau JY, Wu YC, Lin W, and Schmidt W. (2011) iTRAQ protein profile analysis of Arabidopsis roots reveals new aspects critical for iron homeostasis. Plant Physiology. 155:821–834.

Lee WL, Wen TN, Shiau JY, and Shyur LF. (2010) Differential Proteomic Profiling Identifies Novel Molecular Targets of Paclitaxel and Phytoagent Deoxyelephantopin against Mammary Adenocarcinoma Cells. Journal of Proteome Research. 9:237–253.