[邢禹依] 大規模T-DNA水稻突變株族群之外表型鑑定分析

為了解更多水稻註解基因之功能,我們構築一個活化標誌載體(activation tagging vector)、利用台灣稉稻品種台農67號(Tainung 67, TNG67)作為實驗材料,製備了127,000株的T-DNA水稻突變株族群、並廣泛地剔除或活化了約33,000個非跳躍基因(non-transposable element genes)。整體而言,我們在隔離田間一共繁殖了約93,000株的水稻突變株、觀察和記錄78,769株突變株的71個重要農藝性狀、並且收錄59,590株突變株的兩翼序列標誌(flanking sequence tags, FSTs)。秉持資源共享的科學精神,在本實驗室架設的台灣水稻插入突變株網站(Taiwan Rice Insertional Mutants website, TRIM, http://trim.sinica.edu.tw/)裡面,我們使用基因組瀏覽器(Genome Browser)來呈現所有的FSTs資訊,並且與最新發表的期刊論文(Wu et al., 2017, GigaScience, https://doi.org/10.1093/gigascience/gix055)同步釋出所有的假定外表型紀錄。使用者可以藉由水稻註解基因編號、基因註解關鍵字、染色體位置、突變株號碼、以及特定外表型來搜尋到特定突變株。倘若此特定突變株具有種子庫存紀錄,使用者便有機會向水稻T-DNA生技研發中心(T-DNA Tagged Rice Service Center, TTRSC, http://tdna.bts.asia.edu.tw/)申請到保存良好的T2種子(約72.7%的突變株具有種子庫存紀錄)。